Đại hội lần thứ III, nhiệm kỳ 2002 - 2005 của Đảng bộ cơ quan Kiểm toán Nhà nước (KTNN) đánh dấu bước ngoặt mười năm xây dựng và phát triển của KTNN; đồng thời cũng đánh dấu sự trưởng thành, tiến bộ của đội ngũ cán bộ, đảng viên trong toàn Đảng bộ. Kiểm toán Nhà nước được Đảng và Nhà nước tặng thưởng Huân chương Lao động hạng nhất. Phần thưởng cao quý đó không chỉ ghi nhận những cố gắng, nỗ lực của toàn thể cán bộ, công chức, viên chức và người lao động trong hoạt động chuyên môn, nghiệp vụ mà còn khẳng định sự đoàn kết, thống nhất về chính trị, tư tưởng và tổ chức của Đảng bộ trong công tác lãnh đạo, chỉ đạo và tổ chức thực hiện nhiệm vụ chuyên môn.

Ngày 23/5/2006, Công đoàn Viên chức Việt Nam ra Văn bản số 136/CV-CĐVCVN hướng dẫn các Công đoàn trực thuộc thực hiện Tháng hành động vì trẻ em, Ngày gia đình Việt Nam; tổ chức thực hiện các Ngày dân số thế giới, Ngày dân số Việt Nam; triển khai chiến dịch truyền thông phòng chống AIDS và Ngày toàn dân phòng chống ma túy.

Ngày 20/2/2005, tại trụ sở cơ quan Kiểm toán Nhà nước(KTNN), Đoàn Thanh niên cơ quan KTNN đã tổ chức triển khai thực hiện quy định về "Nếp sống văn minh nơi công sở".

Những năm qua, Kiểm toán Nhà Nước đang trong quá trình kiện toàn tổ chức bộ máy và khẳng định địa vị pháp lý của mình nên số lượng cán bộ được tăng lên một cách nhanh chóng, chất lượng cán bộ ngày một nâng cao. Theo đó, số lượng đoàn viên được tăng nhanh, và được bổ sung hàng năm, số lượng chi đoàn trực thuộc cũng được phát triển, chất lượng đoàn viên, thanh niên được nâng cao, hoạt động của các chi đoàn ngày càng rõ nét và đi vào chiều sâu, đoàn viên, thanh niên nhiệt tình, tích cực tham gia các hoạt động Đoàn và có nhiều hoạt động thiết thực, bổ ích tạo nên truyền thống tốt đẹp của Đoàn thanh niên KTNN sau 10 năm hoạt động.